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Dernière mise à jour : Mai 2018

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NICS

Création d'un atlas 3D IRM haute résolution du cerveau ovin

Vue tridimensionnelle du cerveau de brebis reconstruite et segmentée sur des images IRM
© Ella
Un outil aux applications multiples...

Grâce au travail d'Arsène Ella, un atlas IRM du cerveau ovin devient pour la première fois disponible!

Dans le domaine des neurosciences, l’imagerie par résonance magnétique (IRM) est une méthode d’investigation des bases neurobiologiques des processus comportementaux, neuroendocriniens ou cognitifs. Peu invasive, cette méthode n'était jusqu'à présent que peu développée pour les études utilisant les ovins comme modèle expérimental, car l'utilisation de l'IRM nécessite de disposer de références spécifiques à chaque espèce animale. L'objectif de nos travaux a été de créer ces outils de référence pour l'espèce ovine.

Ainsi, un modèle numérique de cerveau "moyen" (ou template) a été réalisé par un alignement de cerveaux de plusieurs individus. Il a été obtenu en utilisant les deux grands types de séquences IRM, (séquences en T1 et T2) qui offrent des contrastes d’images différents et complémentaires. Il a été réalisé en segmentant et en annotant les trois grands types de tissus cérébraux que sont la matière blanche, la matière grise, et le liquide céphalo-rachidien.

La levée de ce verrou méthodologique permettra de propager considérablement l'utilisation d'approches IRM sur le modèle ovin qui est un modèle expérimental en agronomie mais aussi dans différents champs fondamentaux ou cliniques en neurosciences, comme par exemple la pédiatrie.

Cet outil a déjà été disséminé auprès de collaborateurs travaillant aux Etats-Unis (Utah University), en Grande-Bretagne (Edinburgh University), en Australie (University of Western Australia) ou en Nouvelle-Zélande (Lincoln University, University of Otago) sur des thématiques diverses comme par exemple les pathologies pédiatriques ou dégénératives du système nerveux central.

Référence bibliographique:

Ella A, Delgadillo JA, Chemineau P, Keller M. (2017). Computation of a high-resolution MRI 3D stereotaxic atlas of the sheep brain. J Comp Neurol. 525(3):676-692. doi: 10.1002/cne.24079