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31326 Castanet Tolosan cedex - France

Dernière mise à jour : Mai 2021

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PIXANIM : Phénotypage par Imagerie in/eX vivo de l’ANImal à la Molécule

Infrastructures & Equipements

Un seul site
© PIXANIM@INRAE
Avec plus de 1000 m2 de locaux, la plate-forme PIXANIM réunit toutes ses forces sur un même site.

Les infrastructures de la plate-forme PIXANIM regroupent :

  • des locaux pour l'accueil, l'hébergement et le suivi des animaux, adaptés aux différentes espèces animales
  • des salles dédiées à la physiologie interventionnelle permettant la réalisation de formations
  • des laboratoires
  • des équipements.

L'ensemble de ces locaux dispose d'installations techniques et équipements nécessaires à leur fonctionnement selon les besoins expérimentaux et/ou analytiques.

Accueil des animaux, hébergement et salles de physiologie interventionnelle

Hebergement-salles

©PIXANIM@INRAE

Les locaux sont composés de :

  • 3 salles (blocs) équipées d'appareils d’anesthésie et d'assistance respiratoire dont 1 salle dédiée à l'étude de la vascularisation (avec un amplificateur de brillance)
  • 1 salle de formation permettant d’assurer parallèlement la gestion de 9 animaux
  • 1 salle de mise à jeun
  • 1 salle d’anesthésie 
  • 5 salles post-interventions pouvant accueillir jusqu'à 40 ovins/caprins 
  • 1 salle Pré/post-intervention chauffée et climatisée dédiée aux porcins équipée de 9 cases pouvant accueillir de 9 à 20 animaux selon le poids.

Les salles peuvent être équipées de bistouris électriques, d'appareils de monitoring, de colonne de coeliochirurgie et d'équipements mobiles (échographe 3D-doppler, endomicroscope confocal laser).

Laboratoires

Laboratoire Analyses Moléculaires

©PIXANIM@INRAE

La plate-forme s'est dotée d'espaces de laboratoires dédiés aux bioséparations (Electrophorèse, Chromatographie) ou à la préparation d'échantillons pour la protéomique/lipidomique.

Equipements :

  • IRM 3 Teslas Siemens Magnetom Verio®
IRM

©PIXANIM@INRAE

  • CT Siemens Somatom® Definition AS 128
CT-scan

©PIXANIM@INRAE

  • Amplificateur de brillance Siemens Arcadis Avantic
Amplificateur de brillance

©PIXANIM@INRAE

  • Endomicroscope confocal laser Cellvizio Dual Band® Mauna Kea Technologies
Cell Vizio

©PIXANIM@INRAE

  • Echographe-doppler ultrasons Ultrasonix SonixTouch®
Echographe 3D

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  • Spectromètre de masse MALDI-TOF RapifleX TissueTyper & Biotyper Bruker Daltonics
Rapiflex MALDI-TOF

©PIXANIM@INRAE

  • Spectromètre de masse LTQ Velos Pro Obitrap Thermofisher couplé à un système nanoUPLC Ultimate 3000 RSLC Thermofisher
UPLC-LTQ Velos Pro Orbitrap

©PIXANIM@INRAE

  • Système capillaire UPLC Ultimate 3000 Thermofisher
U3000 HPLC

©PIXANIM@INRAE

Robot de préparation de coupes de tissus ImagePrep Bruker Daltonics

Robot Imageprep

©Bruker

  • Robot de préparation de coupes de tissus M5 sprayer HTX Technologies
Robot M5 sprayer

©PIXANIM@INRAE

  • Systèmes d'isoelectrofocalisation : IPGphor et Multiphor II (Amersham Biosciences) et Protean IEF cell (Biorad)
Protean IEF Cell

©Bio-Rad

  • Systèmes d'électrophorèse : SE 660 (Amersham Biosciences) et Ettan DALT et Protean plus Dodeca Cell (Biorad)
Protean_plus_dodeca

©Bio-Rad

  • Analyseurs d'images de gels 1D/2D : Doceda Stainers (Biorad) et ImageScanner (GE Healthcare)
Analyse d'image_scanner

©PIXANIM@INRAE

Outils bioinformatiques associés :

    • ProteinDiscoverer V2.1(ThermoFisher)
    • Mascot Server local V2.7 (Matrix Science)
    • Peaks Studio et Peaks viewer V7.0 (Bioinformatics solutions)
    • Progenesis MALDI V1.2 (Nonlinear Dynamics)
    • SIEVE V1.3 (ThermoFisher)
    • ProSight V4.0 (ThermoFisher)
    • ProMass (Thermofisher)
    • Scaffold Q+ V4.11(Proteome Software)
    • Scaffold PTM 3.3 (Proteome Software)
    • Scaffold PerSPECtives 3.1 (Proteome Software)
    • FlexAnalysis (Bruker)
    • ProteinScape (Bruker)
    • GlycoQuest (Bruker)
    • FlexImaging 5.0 (Bruker)
    • SCiLS Lab 2D/3D 2020(Bruker)
    • ClinProTools 3.0 (Bruker)
    • MALDI Biotyper 4.1 (Bruker)
    • Progenesis SameSpots
    • Total Lab Quant