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Dernière mise à jour : Mai 2018

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Inra Val de Loire - UR Amélioration, génétique et physiologie forestières

Site de l'UR AGPF de l'INRA

Gilles PILATE (Directeur de Recherches - HDR)

Gilles PILATE
Équipe Physiologie Moléculaire de la Formation du Bois (BOIS) - "Décryptage des mécanismes moléculaires impliqués dans la formation du bois"

https://www6.val-de-loire.inrae.fr/biofora/Recherche/Equipe-BOIS 

gilles.pilate@inrae.fr

Fonctions

Directeur de Recherches à l’UMR BioForA (Biologie intégrée pour la valorisation de la diversité des arbres et de la forêt, rattachée au département ECOFA) 

Responsable scientifique du LICA (https://www6.inrae.fr/lica) 

Chargé de mission auprès de la Présidence du Centre INRAE Val de Loire

Diplômes

  • 2019. DU BioInformatique Intégrée, Université Paris Diderot
  • 2002. HDR Sciences de la Vie, CNU section 66, UFR Sciences, Université d’Orléans
  • 1985-1987. Thèse de l’Université Paris VI, Sciences de la Vie, Biologie et Physiologie végétales, Laboratoire d’Ontogenèse expérimentale, Université Paris VI, bourse MRT. Etude du role des phytohormones dans le développement végétatif et floral chez Pseudotsuga menziesii (Mirb.) Franco, par des méthodes immunoenzymatiques.
  • 1984. DEA de Biologie et Physiologie Végétales, Université Paris VI. Contribution à l’étude de la micropropagation de la jojoba, Simmondsia chinensis (Link) Schneid.

Expériences professionnelles

  • Novembre 1991-présent. Chercheur INRA puis INRAE, UMR BioForA, Centre Val de Loire
  • 1989-1991. Research Associate, Conifer Biotechnology Lab, Plant Biotechnology Institute, NRCC, Saskatoon, Saskatchewan, Canada
  • 1988. Stage post-doctoral, Molecular Genetic Lab, Biological Science Division, NRCC, Ottawa, Ontario, Canada, Summit Canadian fellowship.

Sociétés savantes

  • 2009. Elu à l’ “International Academy of Wood Science”

Thèmes de Recherche / techniques utilisées

  • Etude des déterminants moléculaires responsable des contraintes mises en place dans le bois de tension (collaboration avec LMGC (CNRS Montpellier) et ECOFOG UMR INRAE CNRS Guyane, projet ANR Blanc ‘Stress in Trees’, thèses de Fernanda Guedes et de Amra Secerovic
  • Aptitude à la saccharification de bois de peupliers GM à lignines modifiées. Collaboration avec le VIB Ghent, BIA INRAE Nantes, IJPB INRAE Versailles, FARE INRAE Reims
  • Bois de tension : peluchage et aptitude à la saccharification (projet FP7 EnergyPoplar, projet ANR Blanc Stress in Trees, projet régional OPeNSPeNU)
  • Vers l’élaboration d’un modèle de construction des parois secondaires des fibres de bois chez le peuplier (thèse de Clément Cuello)
  • Mise en oeuvre des nouvelles techniques d’édition du génome sur le peuplier (projet PIA Genius)

Projets en cours

  • Projet OPeNSPeNU “Odeur et Peluchage Naturel : Sélection de Peupliers pour de Nouveaux Usages”, Projet Intérêt Régional, 2017-2020, Coordinateur.
  • Projet Genius “Genome ENgineering Improvement for Useful plants of a Sustainable agriculture”, Projet Investissement Avenir, 2011-2020.
  • Projet “Evaluation quantitative et qualitative de la ressource française en peuplier tremble pour la production de moules de cuisson.”, AMI Ministère de l'agriculture et de l'alimentation, 2020.
  • Projet PRESTO “Prédiction haut-débit de la vulnérabilité des arbres et de la vigne à des stress biotiques et abiotiques”, Projet Intérêt Régional, 2020-2022.

Encadrement

Thèses :

  • 2017-2020 Clément Cuello, Vers l’élaboration d’un modèle de construction des parois des fibres de bois de peuplier, Université Orléans, Bourse Université - ex-MENRT, co-direction avec Annabelle Déjardin
  • 2013-2016 Amra Šećerović, Université Orléans. Identification et caractérisation des acteurs moléculaires responsables des propriétés mécaniques du bois de tension chez des espèces avec ou sans couches G. Bourse de thèse INRA - Projet ANR Blanc StressInTrees, co-direction avec  Annabelle Déjardin
  • 2010-2013 Fernanda Guedes, Université Orléans. Recherche des molécules responsables des propriétés gélifiantes de la couche G du bois de tension de peuplier. Bourse CAPES (Coordination for the Improvement of Higher Level Personnel, Brazilian Ministry of Education).
  • 2007-2010 Régis Fichot, Université Orléans. Variabilité structurale et fonctionnelle du xylème et plasticité en réponse à la sécheresse chez le peuplier. Bourse MRT, co-direction avec Franck Brignolas (LBLGC, Université Orléans)
  • 2004-2007 Dominique Arnaud, Université Orléans.  Identification et caractérisation de la famille de protéines à domaine LIM chez le peuplier. Co-direction avec Daniel Locker, 324 p
  • 1999-2003 Florian Lafarguette, Université Orléans. Identification et caractérisation de gènes impliqués dans la formation du bois de tension chez le peuplier. Bourse région Centre, 181p
  • 1999-2002 Melinda Gatineau, Université Orléans. Vers une meilleure compréhension de l’absence de monomères de type syringyl dans les lignines de conifère : une approche par transformation génétique. Co-direction avec Marie-Anne Lelu, Bourse région Centre, 117p
  • 1993-1996 Valérie Levée, Université Orléans. Transformation via Agrobacterium tumefaciens du mélèze hybride (Larix x leptoeuropaea) et régénération de plants transgéniques. Co-direction avec Marie-Anne Lelu, Bourse région Centre/INRA, 120p
  • 1994-1997 Françoise Laurans, Université Orléans. Définition histologique et approche moléculaire des interactions peupliers/rouilles, Populus deltoides x P. nigra cv. 'Ogy' / Melampsora larici-populina races E1 et E2. Bourse MRT, 138p

Master 2 :

  • Estelle Fedirko, 2009. Evaluation de l’existence d’un rythme circadien dans l’expression des gènes impliqués dans la formation du bois de peuplier. Master2 Biologie Moléculaire et Cellulaire, Université Orléans, co-encadrement avec Jean-Charles Leplé.
  • Julien Toillon, 2009. Stabilité des modifications génétiques induites par transgénèse sur des peupliers de 10 ans. Master2, Master Végétal Grand Ouest BioVIGPA
  • Agathe Courtelle, 2009. Initiation de la transformation génétique sur les individus d’une famille F1 de Populus deltoides x Populus trichocarpa, afin de valider des gènes candidats pour la résistance à la rouille (Melampsora larici populina). Master2 ENSAIA/Univ H Poincaré Nancy, co-encadrement avec Véronique Jorge
  • Fichot R, 2006. Impact d’une sécheresse modérée sur la diversité génotypique de l’anatomie du bois de peupliers contrastés pour leur discrimination isotopique vis-à-vis du carbone. Master2, ETAH, Université d’Orléans, co-encadrement avec Franck Brignolas
  • Martin Carine, 2003. Vers l’identification de protéines régulant la formation de bois de tension chez le peuplier. DEA Biologie et Biophysique Moléculaires, Université Orléans
  • Florian Lafarguette, 1999. Identification par AFLP-ADNc de gènes régulés lors de la formation du bois de tension chez le peuplier. DEA de Biologie Forestière, Université NancyI (co-encadrement avec J.-C. Leplé).
  • M’Barek Tamasloukht, 1998. Caractérisations moléculaires de plants de mélèze hybride transgéniques surexprimant un gène de la lignification : effet sur la composition en lignine. DEA de Biologie Forestière, Université NancyI, co-encadrement avec Marie-Anne Lelu
  • Christophe Ripoll, 1996. Etude de la réponse précoce à la blessure des feuilles de peuplier: caractérisation des profils d'expression des gènes de défense. DEA de Biologie, diversité et adaptation des plantes cultivées, option Phytopathologie, Université ParisXI
  • Nathalie Noël, 1996. Mise au point de la transformation génétique de clones de peupliers d'intérêt économique via Agrobacterium tumefaciens. DESS de Productivité Végétale, Université Paris VII, co-encadrement avec J.-C. Leplé
  • Stéphanie Chartier, 1994. Recherche de corrélations entre composés phénoliques et résistance du peuplier à la rouille Melampsora larici-populina. DEA de Biologie Forestière, Université Nancy I
  • Françoise Laurans, 1993. Developpement d'un système d'expression transitoire par electroporation de protoplastes et microprojection, chez le peuplier (Populus  tremula x Populus alba) et le mélèze (Larix x leptoeuropaea) hybrides. DEA de Biologie Forestière, Université Nancy I
  • Christophe Pruvost, 1992. Transformation du peuplier. DESS de Productivité Végétale, Université Paris VII, co-encadrement avec Lise Jouanin.

Autres stages :

  • José Manuel Ramos, 2013. Creation of a binary vector suitable for the expression in planta of a transgene under the control of a wood specific promoter. STSM Action COST FP0905April.
  • Magali Corviolle, 2011. Biblio Arbres OGM, formation complément Faculté de Pharmacie de Tours, Avril-Mai
  • Maja Popovic, 2011. A database of references related to field trials with transgenic trees. STSM Action COST FP0905, Aout-Septembre
  • Justine Guet, 2010. Etude de la variabilité de l’aptitude à former du bois de tension chez différents génotypes de peuplier. Master1 Ecosystèmes Terrestres, Université Orléans, 3 Mai - 18 Juin, co-encadrement avec Vincent Segura et Françoise Laurans
  • Nicolas Durand, 2006. Etude de l’interaction entre une sécheresse modérée et un stress mécanique sur la formation du bois chez le peuplier. Master1, ETAH, Université Orléans, co-encadrement avec Franck Brignolas
  • Miyuki Takeuchi, 2006. Study of Tension Wood Specific Arabinogalactan-proteins. Stage Post-doctoral, Bourse INRA Post-Doc, Novembre 2005-Décembre 2006, co-encadrement avec Brigitte Chabbert
  • Régis Fichot, 2005. Impact d’une sécheresse modérée sur l’anatomie du bois chez un clone de peuplier hybride euraméricain Populus deltoides (Bartr.) Marsh. x Populus nigra L. Master1 ETAH, Université Orléans, co-encadrement avec Franck Brignolas
  • Lucie François, 2005. Etude de l’expression des gènes de la famille des HD-ZIP III au cours de la formation du bois chez le peuplier. Stage de Master1 IUP Biotechnologies appliquées au végétal, Université Paul Sabatier, Toulouse, co-encadrement avec Jean-Charles Leplé et Annabelle Déjardin
  • Cyril Saintenac, 2004. Etude expressionnelle de gènes par RT-PCR semi quantitative au cours de la formation du bois de tension. Maîtrise de Biologie Cellulaire et Physiologie, Université Blaise Pascal, Clermont-Ferrand, co-encadrement avec Jean-Charles Leplé
  • Laila Lahlimi, 2002. Evaluation d’une approche de normalisation virtuelle sur des banques d’ADNc de bois de peuplier dans le cadre d’un projet de séquençage d’EST. DIRS, Université Tours, co-encadrement avec Annabelle Déjardin
  • Mélodie Fourez, 2002. Caractérisation de lignées transgéniques de peupliers transformés avec le gène MYB308. IUT, Département Génie Biologique, Tours.
  • Alexandre Amy, 2002. Construction d’une banque d’ADNc de cambium de peuplier. BTS Biotechnologie, St Jean de Braye, co-encadrement ave Annabelle Déjardin
  • Patricia Jeannin, 2001. Mise au point d’un protocole d’amplification en masse d’ADNc de bois de tension du peuplier avant squenage. BTS Biochimie, Bourges, co-encadrement avec Annabelle Déjardin

Publications