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Technicienne en biologie moléculaire, je travaille à l’INRA d’Orléans depuis 1998. Rattachée à l’équipe Génétique, Adaptation et Amélioration (GA²) qui est l’une des équipes qui composent l’UMR BioForA, je réalise des opérations de génotypage dans le cadre de différents programmes d’amélioration génétique et d’études de diversité génétique chez plusieurs espèces forestières. Selon les besoins de l’UMR et de l’UE GBFor, je suis également chargée de valider l’identification des génotypes mis en collection par des techniques moléculaires et peux aussi répondre à des demandes extérieures comme par exemple la recherche de taux d’hybrides dans des lots de graines.

• Dans ce cadre, j’organise et j’effectue la récolte du matériel végétal en pépinière ou sur sites naturels (ex : peuplier noir).
• Ensuite, j’utilise les techniques et les protocoles utilisés au laboratoire pour extraire leurs ADN en utilisant des kits commerciaux ou des techniques plus classiques (extraction d’ADN au CTAB).

Récolte de feuilles de peuplier à la pépinière de Guémené-Penfao	Extraction d’ADN en plaque 96 puits

• Après avoir vérifié leur qualité, ces ADN sont utilisés pour caractériser les génotypes de chaque individu à l’aide de différents types de marqueurs basés principalement la détection de différences de taille des fragments d’ADN amplifiés par PCR (« Polymerase Chain Reaction ») soit après migration en gel d’agarose (marqueurs moléculaire de type RFLP _ Restriction Fragment Lenght Polymorphism) ou à l’aide d’un séquenceur d’ADN (marqueurs moléculaires de type microsatellite). Dans ce dernier cas, je recueille les données en sortie du séquenceur et les exploite avec le logiciel GeneMapper pour fournir un tableau de données validées aux scientifiques demandeurs.

Thermocycleur  : appareil automatisant la réaction de PCR	Chromatographes représentant différentes tailles d’allèles représentées sous forme de pics en sortie séquenceur visualisés avec le logiciel GeneMapper

Je participe à différents projets impliquant l’unité ou l’équipe GA² (EpiTree, GenTree, QuaseGraines, GIS Peuplier, Breed to Last, BioMareau, … ) et les différentes opérations de génotypage que je réalise concernent :

• La préparation d’ADN pour des plateformes de séquençage haut débit
• L’identification et la confirmation des génotypes de peupliers, mélèzes et frênes mis en collection ou utilisés dans des tests.
• La détermination de l’espèce chez le genre Larix  : d’Europe, du Japon ou hybride, à partir d’aiguilles, de bourgeons ou d’embryons. Echantillons provenant de collections, de lots de plants ou de graines de vergers à graines.
• L’identification des d’hybrides dans des lots de graines de mélèze et un suivi de leurs évolutions entre graines, plantules et jeunes plants issus d’un même lot.
•  La recherche de polymorphisme chez le peuplier.
• La vérification des croisements (comparaison parents/descendant) effectués dans des programmes d’amélioration du peuplier.
• La cartographie génétique chez le peuplier noir
• La caractérisation de diversité chez le peuplier, le mélèze, et prochainement le Pin Sylvestre.

 Publications, posters et autres, …

Philippe G., Buret, C., Matz S., Pâques L. (2016) Composition of hybrid larch (Larix × eurolepis Henry) forest reproductive materials: How much does hybrid percentage affect stand performance? New Forests, 2016, 47: 541–564. Doi : 10.1007/s11056-016-9530-z

Serres-Giardi L., Dufour J., Russell K., Buret C., Laurans F., Santi F. (2010) Natural triploids of wild cherry. Canadian Journal of Forest Research 40 (10) : 1951–1961. https://doi.org/10.1139/X10-100

Segura V., Lesage-Descauses M.-C., Charpentier J.-P., Kinkel K., Mandin C., Ader K., Belmokhtar N., Boizot N., Buret C., Déjardin A., Guérin V., Jorge V., Ridel C., Laurans F., Laine-Prade V., Sanchez Rodriguez L., Bastien C., Gebreselassie M. N., Almeida J.-L., Bodineau G., Poursat P., Rogier O., Caius J., Taconnat L., Balzergue S., Brunaud V., Martin-Magniette M.-L., Leplé J.-C. (2016) A systems biology approach for identifying candidate genes involved in the natural variability of biomass yield and chemical properties in black poplar. Présentation orale et résumé : IUFRO Genomics and Forest Tree Genetics (2016-05-30-2016-06-03) Arcachon (France).

Segura V., Charpentier J.-P., Ader K., Buret C., Boizot N., Pâques L. E. (2015) Determination of Larch Taxa with Near Infrared Spectroscopy. Poster et résumé. 17th International Conference on Near Infrared Spectroscopy (2015-10-18-2015-10-23) Foz do Iguaçu (Brésil).

Philippe G., Matz S., Buret C., Pâques L. (2012) Specific purity of hybrid larch Forest Reproductive Materials: how much does it matter? Présentation orale à LARIX 2012 : Larch in a warm climate. 8th International Symposium of IUFRO Working Group S2.02.07 – Larch Breeding and Genetic Resources (2012-09-11-2012-11-13) Hallormsstaðaskógur National Forest (Islande).

Brachet S., Bastien C., Bilger I., Buret C., Dufour J., Grange J., Guerin V., Jorge V., Le Guerroue B., Lesage-Descauses M.-C., Levèque L., Mardare I., Mariette S., Musch B., Sanchez L., Stoeckel S., Villar M., Santi F. (2006). Stratégies raisonnées d'échantillonnage pour capturer la diversité génétique et sa structuration dans les populations naturelles - Application aux mesures de gestion conservatoire. Article au 6^ème colloque national du BRG : Ressources génétiques : des ressources partagées (2006-10-02 - 2006-10-04) La Rochelle (France), Actes du BRG, 6, Paris.