nathalie.boizot@inrae.fr

Diplômes

 1996 : DESS « Productivité Végétale », Université Paris 7 Denis Diderot

Expériences professionnelles

J’ai intégré l’Unité Amélioration Génétique et Physiologie Forestières (AGPF, devenue BioForA en 2018) en 1996 pour effectuer un stage de 9 mois dans le cadre de mon DESS et j’ai poursuivi le travail engagé en CDD pendant 2 ans comme Assistant Ingénieur. J’avais en charge de mettre au point la transformation génétique de clones de peuplier d’intérêt économique via Agrobacterium tumefaciens.

Recrutée en 1999 au Laboratoire d’Analyses Biochimiques de cette même unité, je développe et mets en œuvre des techniques d’analyses biochimiques, principalement sur le matériau bois mais également sur tout autre organe de l’arbre (feuilles, racines, graines) et ce pour différentes essences.

Thèmes de recherche/Techniques utilisées

Etude des polyphénols et des sucres solubles dans la formation du duramen, la durabilité naturelle et la coloration des bois :

• Chromatographie liquide (CLHP/DEDL et CLHP/DAD) : dosage des sucres et des polyphénols.
• Spectrophotométrie UV-visible : dosage des polyphénols et des catéchines aux réactifs de Folin et DMACA, dosage enzymatique du glucose et de l’amidon.

Caractérisation de la biomasse lignocellulosique :

• Hydrolyses acide et alcaline ; gravimétrie : dosage de la cellulose, lignines, hémicelluloses, cendres.
• Prétraitement hydrothermique (explosion à la vapeur) et hydrolyse enzymatique : détermination du potentiel de saccharification.

Etude des protéines dans la formation de la paroi secondaire des cellules du xylème de peuplier :

• Extraction, quantification, fractionnement, concentration, purification (dialyse, ultrafiltration).
• ImmunoPrécipitation de Chromatine (ChIP).
• Séparation par électrophorèse (IEF, SDS-PAGE, native PAGE) et chromatographie liquide (affinité, échange d’ions, tamisage moléculaire).
• Détection par coloration sur gel, Western blot (détection colorimétrique et ECL).
• Production de protéines recombinantes dans E.coli, purification d’anticorps.

 Caractérisation biochimique de peupliers génétiquement modifiés :

• Dosages par spectrophotométrie et fluorimétrie des activités enzymatiques β-glucuronidase (GUS), ß-galactosidase (GAL), cinnamyl alcool déshydrogénase (CAD), laccases.

Projets

SECUR-MFR “Sécurisation de l'approvisionnement en Matériel Forestier de Reproduction”, AO Innovation et Investissements pour l’amont forestier, 2017-2020.

OPeNSPeNU “Odeur et Peluchage Naturel : Sélection de Peupliers pour de Nouveaux Usages”, Projet Intérêt Régional, 2017-2020.

Chêne&vin “Développement d'outils d'identification d'espèces de chêne et de leur impact sur les vins de Loire”, Projet Intérêt Régional, 2017-2020.

EMBRYONsoMATURE “Porter la MATURité des EMBRYONS SOMATiques de pin maritime au niveau de la référence « semis » pour préparer la multiplication de clones élites par graines artificielles”, Programme de ressourcement scientifique du FCBA, 2018-2021.

2E-BioPop “Itinéraires éco-efficients pour une production de biomasse de qualité en taillis à courtes rotations”, Projet Intérêt Régional, 2018-2021.

MULTIFOREVER “Towards intensification of conifer production through multi-varietal forestry based on somatic embryogenesis”, Projet européen FORESTVALUE, 2019-2022.

“Evaluation quantitative et qualitative de la ressource française en peuplier tremble pour la production de moules de cuisson”, AMI Ministère de l'agriculture et de l'alimentation, 2020.

PRESTO “Prédiction haut-débit de la vulnérabilité des arbres et de la vigne à des stress biotiques et abiotiques”, Projet Intérêt Régional, 2020-2022.

Encadrement technique depuis 2013 :

Doctorant.e.s :

• Parisa Savane (2019-2021) “Caractérisations biologiques, physiologiques et moléculaires de la déshydratation des embryons somatiques et zygotiques de mélèze. Analyses des conséquences en termes de la qualité des graines”, Université d’Orléans. Extraction et dosage des sucres de réserve.
• Manel BORJI (2016-2020) Recherche de marqueurs biochimiques liés à l’embryogenèse somatique chez l’avoine (Avena sativa L. ’Meliane’), Faculté des Sciences de Tunis. Extraction et dosage des sucres de réserve.
• Florian Gautier (2014-2017) “Aptitude du Douglas (Pseudotsuga menziesii) à l’embryogenèse somatique : approches de physiologie cellulaire et moléculaire via l’analyse du protéome et du transcriptome”, Université de Limoges. Extraction et dosage des sucres de réserve.
• Amra Šećerović (2013-2016) “Identification et caractérisation des acteurs moléculaires responsables des propriétés mécaniques du bois de tension chez des espèces avec ou sans couches G”, Université d’Orléans. Activités enzymatiques et Western blot.
• Idelette Plazanet (2013-2016) “Etude de la formation du duramen chez le douglas : approches biochimique et transcriptomique”, Université de Limoges. Optimisation desextractions d’ARN.
• Alexandre Morel (2010-2014) “Physiologie moléculaire du développement des embryons somatiques de pin maritime (Pinus pinaster Ait.) : approches transcriptomique et protéomique”, Université d’Orléans. Extraction et dosage des sucres de réserve.
• Fernanda Guedes (2010-2013) “Recherche des molécules responsables des propriétés gélifiantes de la couche G du bois de tension de peuplier”, Université d’Orléans. Extraction protéiques et Western blot.
• Wassim Lakhal (2010-2013) “Etude fonctionnelle de trois facteurs de transcription impliqués dans la formation de la paroi secondaire chez le peuplier“, Université d’Orléans. Immunoprécipitation de chromatine.

Stagiaires :

• Antoine Poursat (2015) “Analyse des constituants chimiques du bois au sein de populations génétiques de Peuplier noir pour faire de la sélection d'individus pour des besoins de production énergétique”, DUT 2^e année. Dosage des lignines et cellulose.
• Kévin Kinkel (2015) Architecture génétique de la production et de la qualité de la biomasse lignocellulosique chez le peuplier noir en vue de sa valorisation en bio-raffinerie, Licence professionnelle. Dosage de la cellulose.
• Adélaïde Malardier (2014) “Analyse des composants chimiques structuraux (lignines, cellulose) et des composés phénoliques du bois de robinier”, Licence professionnelle. Dosage des lignines, cellulose et polyphénols.
• Elise Serin (2013) “Identification et caractérisation de régions génomiques contrôlant les variations de propriétés chimiques du bois chez le peuplier”, Master 2. Dosage des lignines.
• Sandy Jouet (2013) “Validation de modèles de calibration en spectrométrie proche infra-rouge. Dosage de la cellulose et des lignines dans le bois de peuplier hybride deltoides x trichocarpa. ”, BTS 2^e année, Dosage des lignines et cellulose.

Publications

Gautier, F., Label, P., Eliášová, K., Leplé, J-C., Motyka, V., Boizot, N., Vondráková, Z., Malbeck, J., Trávnícko,vá, A., Le Metté, C., Lesage-Descauses, M-C., Lomenech, A-M., Trontin, J-F., Costa, G., Lelu-Walter, M-A., Teyssier, C., 2019. “Cytological, Biochemical and Molecular Events of the Embryogenic State in Douglas-fir (Pseudotsuga menziesii [Mirb.])“ Frontiers in Plant science, 10, 118, doi: 10.3389/fpls.2019.00118

Guedes, F. T. P., Laurans, F., Quemener, B., Assor, C., Laine-Prade, V., Boizot, N., Vigouroux, J., Lesage Descauses, M.-C., Leplé, J.-C., Dejardin, A., Pilate, G., 2017. Non-cellulosic polysaccharide distribution during G-layer formation in poplar tension wood fibers : abundance of rhamnogalacturonan I and arabinogalactan proteins but no evidence of xyloglucan. Planta 246, 857–878.

Gebreselassie, M. N., Ader, K., Boizot, N., Millier, F., Charpentier, J.-P., Alves, A., Simoes, R., Rodrigues, J. C., Bodineau, G., Fabbrini, F., Sabatti, M., Bastien, C., Segura, V., 2017. Near-infrared spectroscopy enables the genetic analysis of chemical properties in a large set of wood samples from Populus nigra (L.) natural populations. Industrial Crops and Products, 107, 159-171.

Morel A., Teyssier C., Trontin J-F., Eliášová K., Pešek B., Beaufour M., Morabito D., Boizot N., Le Metté C., Belal-Bessai L., Reymond I., Harvengt L., Cadene M., Corbineau F., Vágner M., Label P., Lelu-Walter M-A., 2014. Early molecular events involved in Pinus pinaster Ait. somatic embryo development under reduced water availability: transcriptomic and proteomic analyses. Physiologia Plantarum, 152 (1), 184-201. DOI : 10.1111/ppl.12158).

Arnaud D., Dejardin A., Leplé J-C., Lesage-Descauses M-C., Boizot N., Villar M., Bénédetti H., Pilate G., 2012. Expression analysis of LIM gene family in poplar, toward an updated phylogenetic classification. BMC Research Notes, 2012, 5 : 8 p.

Goue, N., Boizot, N., Vallance, M., Magel, E., Label, P., 2012. Microdissection to isolate vascular cambium cells in poplar. Silva Fennica, 46 (1), 5 - 16.

Pizzo B., Pometti C.L., Charpentier J-P., Boizot N., and Saidman B.O., 2011. Relationships involving several types of extractives of five native argentine wood species of genera Prosopis and Acacia. Industrial Crops and Products 34, 851-859.

Pometti C.L., Palanti S., Pizzo B., Charpentier J-P., Boizot N., Resio C., Saidman B.O., 2010. Durability of five native Argentine wood species of the genera Prosopis and Acacia decayed by rot fungi and its relationship with extractive content. Biodegradation 21 (5), 753-760.

Giordanengo T., Charpentier J-P., Boizot N., Roussel S., Roger J-M., Chaix G., Robin C., Mourey N., 2009. OakScan™ : procédé de mesure rapide et non destructif des polyphénols du bois de chêne de tonnellerie. Revue Française d’Œnologie, 181, 10-13.

Boizot N., Charpentier JP, 2006. Méthode rapide d’évaluation du contenu en composés phénoliques des organes d’un arbre forestier, Le cahier des techniques de l’INRA n° spécial : « Méthodes et outils pour l’observation et l’évaluation des milieux forestiers, prairiaux et aquatiques », 79-82.

Leple, J.-C., Dejardin, A., Laurans, F., Pilate, G., Goué, N., Label, P., Beritognolo, I., Boizot, N., Breton, C. (2004). Physiologie et génomique de la formation du bois. Biofutur (247), 43-48.

Noël N., Leplé J-C, Pilate G, 2002. Optimization of in vitro micropropagation and regeneration for Populus x interamericana and Populus x euramericana hybrids (P. deltoides, P. trichocarpa and P. nigra). Plant Cell Reports, 20, 1150-1155.