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Dernière mise à jour : Mai 2018

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Inra Val de Loire - UR Amélioration, génétique et physiologie forestières

Site de l'UR AGPF de l'INRA

Clément CUELLO (Boursier de Thèse)

Clément CUELLO
Équipe Physiologie Moléculaire de la Formation du Bois (BOIS) - "Vers l'élaboration d'un modèle de construction des parois secondaires des fibres de bois chez le Peuplier"

Encadrant : Annabelle Déjardin

Du 01/10/2017 au 30/09/2020

Contact : clement.cuello@inrae.fr ; clement.cuello@outlook.com

Fonction

  • Doctorant à BioForA encadré par Annabelle Déjardin, Gilles Pilate et Françoise Laurans
  • Intervenant dans le cadre du projet EDIFICE 2.0 – représentant des doctorants au conseil de perfectionnement
  • Représentant des non-permanents – membre du conseil de service
  • Membre du comité local d’organisation des journées scientifiques et techniques du réseau des microscopistes INRAE 2020
  • Vice-trésorier de l’association des doctorants scientifiques d’Orléans
  • Représentant suppléant des doctorants auprès de l’école doctorale SSBCV

Diplômes

En cours

Doctorat en Biologie végétale de l’Université d’Orléans – école doctorale ‘Santé, Sciences Biologiques et Chimie du Vivant’
Filière : Chimie et Physique du vivant
Spécialité : Aspects cellulaires et moléculaires de la biologie

2016

Diplôme d’Ingénieur Agronome de l’Institut Supérieur d’Agriculture Rhône-Alpes (ISARA-Lyon)
Spécialisation : Agriculture, environnement et gestion des ressources
Approfondissement : Génétique, Pathologie et Amélioration des plantes (Faculté des bioingénieurs, Université Catholique de Louvain-la-Neuve, Belgique).

Formations complémentaires

2019

Formation (3 x 4h) : « imageJ : initiation », FP INRA, Nouzilly (37), France
Formation (20h) : « Pédagogie universitaire », Université d’Orléans, Orléans (45), France

2018

Formation (20h) : « Droit de l’informatique », Graduate School Orléans Numérique – Université d’Orléans, Orléans (45), France

2017

MOOC (42h) : « Che-MOOCs-basic : les bases de la chimiométrie », Agreenium via France Université Numérique
Formation (1 jour, 8h) : « Genome Wide Association Study », INRA GQE-Le Moulon via le projet Amaizing, Gif-sur-Yvette (91), France

2016

École d’été (6 jours) : « From gene expression to genomic network », LabEx Saclay Plant Science, Saint-Lambert (78), France

Expériences professionnelles

2016 – 2017

Ingénieur d’études sous la direction de Sylvie Coursol et Matthieu Reymond, équipe Qualité de la biomasse et interaction avec la sècheresse, Institut Jean-Pierre Bourgin, Versailles (78), France

Mission : « Analyses transcriptomiques et génomiques en vue de l'identification des déterminants génétiques sous-jacents à un locus impliqué dans la dégradabilité du maïs fourrage » (Projet Biomass For the Future)

2016

Stage recherche sous la direction de Sylvie Coursol et Matthieu Reymond, équipe Qualité de la biomasse et interaction avec la sècheresse, Institut Jean-Pierre Bourgin, Versailles (78), France
Titre : « Analyse génétique de la dégradabilité de la biomasse végétale chez le maïs – Une approche associant un séquençage de BAC à un séquençage du transcriptome. » (Projet ZeaWall II, ProMaïs)
Félicitations du jury

2014

Stage recherche sous la direction de Cyriaque Le Gouguec, service R&D, Trois Bulbes SAS, Bretenières (21), France
Titre : « Mise en place d’un test de résistance à la fusariose (Fusarium oxysporum spp. cepae) chez l’oignon »

Thèmes de recherche et expertise technique

Thèmes de recherche

Compréhension des mécanismes associés à la formation du bois à l’échelle cellulaire en lien avec la mise en place des propriétés physico-chimiques du bois

  • Identification des caractéristiques physico-chimiques des parois de chaque type cellulaire (fibres, rayons, vaisseaux) chez différentes lignées transgéniques
  • Caractérisation transcriptomiques associés au développement des fibres
  • Développements méthodologiques liés au microphénotypage, à la microtranscriptomique et à l’association des données phénomiques et transcriptomiques obtenues.

Expertise technique

Biologie cellulaire

Préparation de protoplastes de xylème secondaire

Histologie

Microspectroscopie ATR-FTIR (Spectrum 400 couplé à Spotlight 400, Perkin Elmer)
Hybridation in situ

Biologie moléculaire

Single-cell RNA sequencing

Biostatistique et analyses de données sous R

Congrès

Communication orales

13/06/2019

Journée xylogénèse, Paris (75), France
« Apport de l’imagerie infra-rouge pour l’étude de la formation du bois »

14-16/05/2019

Journée du réseau français des parois, Roscoff (29), France
« Imagerie ATR-FTIR : phénotypage à l’échelle de la paroi dans le modèle bois de tension de peuplier »

24-28/03/2019

2nd International plant spectroscopy conference, Berlin, Germany
« ATR-FTIR imaging : phenotyping at the cell wall level in poplar wood »

04/10/2018

Paris Single Cell Day
« ATR-FTIR imaging : phenotyping at the cell wall level in poplar wood »

Posters

10-11/10/2019

Journées scientifiques du GDR Sciences du bois, Épinal (88), France
« Microspectroscopie ATR-FTIR : nouvelle méthode de phénotypage à l'échelle de la paroi »

10-11/10/2019

Colloque BioTechnoCentre, Seillac (41), France
« Ce peuplier, quelle bonne pâte (à papier) »
Prix du meilleur poster

14-16/05/2019

Journée du réseau français des parois, Roscoff (29), France
« Caractérisation de lignées de peupliers transgéniques par (micro-) spectroscopie ATR-FTIR »

21-23/10/2018

Journées scientifiques et techniques du réseau des microscopistes INRAE, Clermont-Ferrand (63), France
« Imagerie ATR-FTIR : caractérisation du bois à l’échelle de la paroi végétale »

11-12/10/2018

Colloque BioTechnoCentre, Seillac (41), France
« Imagerie ATR-FTIR : caractérisation du bois à l’échelle de la paroi végétale »

Encadrement

2020

Laurent Chapillon, Master 2 Traitement du signal et de l’image, Université de Bourgogne (21)
Reconnaissance de types cellulaires à partir d’images infra-rouge : comparaison de modèles statistiques (co-encadrement Aurélien Chateigner, Julien Mille [INSA Blois])

2019

Dylan Amiar, L3 Biologie des organismes, des populations et des écosystèmes, Université d’Orléans (45)
Production d’échantillons

Alexandre Cordier, Master 1 Biologie Végétale, Université d’Angers (49)
Contribution à l’optimisation de la préparation de protoplastes de xylème secondaire

Romaric Monteil, Master 2 Sciences Végétales – ECOproduction et BIOVALOrisation, Université de Rouen (76), Université de Caen (14), UniLaSalle (60).
Micro-caractérisation de lignées de peuplier transgéniques

Publications

Cuello C, Marchand P, Laurans F, Grand-Perret C, Lainé-Prade V, Pilate G, Déjardin A (2020) ATR-FTIR Microspectroscopy Brings a Novel Insight Into the Study of Cell Wall Chemistry at the Cellular Level. Front. Plant Sci. 11:105. doi: 10.3389/fpls.2020.00105

Cuello, C, Baldy, A, Brunaud, V, Joets, J, Delannoy, E, Jacquemot, MP, Botran, LR, Griveau, Y, Guichard, C, Soubigou-Taconnat, L, Martin-Magniette, ML, Leroy, P, Mechin, V, Reymond, M, Coursol, S (2019). A systems biology approach uncovers a gene co-expression network associated with cell wall degradability in maize. PLOS ONE, 14 (12). , doi: 10.1371/journal.pone.0227011